Allora , se non hai cambiato ROM, puoi direttamente formattare cancellando i dati e le applicazioni per ritornare allo stato di fabbrica, se hai cambiato rom invece devi reinstallare la rom stock del tuo terminale. cmq da quello che posso capire hai fatto il root e hai cancellato alcune app di sistema giusto???, il problema è che non so se HTC ha una sorta di contatore che non appena fai il root ti invalida la garanzia, cmq se vuoi aggiornare la versione di android le cose sono due:
Puoi installare manualmente la ROM di android che desideri
Oppure, provi a formattare il terminale allo stato iniziale per vedere se si riattivano gli aggiornamenti OTA (cmq in genere le grandi aziende una volta che fai il root ti tolgono la possibilità di fare aggiornamenti in automatico ma li devi fare sempre tu ogni volta in manuale) preciso che non sono sicuro se HTC ti blocca la possibilità di ritornare allo stato iniziale (e la garanzia) topo come fa Samsung con il contatore knoxs